주문진성당은 양양, 금광리에 이어 영동지역의 세 번째 본당으로 1923년 설립되었다. 

한국전쟁 직후 모두가 혼란과 빈곤을 겪고 있을 시기에 주문진성당은 배급받은 구호물자를 지역주민들과 나누며, 신앙의 공간을 넘어 모두에게 열려 있는 종교적 쉼터의 역할을 수행했다. 또한 1960년대에는 신협을 운영하며 신자들뿐만 아니라 지역주민의 경제적 자립을 돕는 활동을 전개하여 지역사회와의 상생을 실천하였다.

성당의 머릿돌을 통해 1955년 완공 사실을 확인할 수 있으며, 이후 종탑 보수와 여러 차례의 개‧보수를 통해 오늘날의 모습을 갖추었다. 특히 성당의 벽체 마감 방식과 내부 공간 구성은 1950년대 당시의 건축기술 수준을 가늠하게 하는 중요한 단서를 제공한다.

주문진성당은 주문진에서 가장 높은 곳에 자리한 건축물로, 오랜 세월 동안 지역을 대표하는 상징적 건축물로 주민들의 기억 속에 깊이 각인되어 왔다. 1955년 완공 이후 오늘에 이르기까지 주문진성당은 지역사회와 함께 호흡하며, 이 일대 천주교 전파의 중심지 역할을 수행해 왔다.

이러한 건축적‧교회사적 가치를 인정받아, 주문진성당은 2025년 3월 28일 강원특별자치도에서 처음으로 도등록문화유산으로 지정되었다.